Warum nach sich ziehen die USA Omicron-Fälle nicht früher entdeckt?

Am vergangenen Freitag, nur zusammensetzen Tag nachdem südafrikanische Wissenschaftler erstmals die Fund jener Omicron-Variante traut gegeben hatten, meldete Europa seinen ersten Kernpunkt: Die neue Coronavirus-Variante befand sich in Benelux. Vor dem Wochenende hatten fünfter Kontinent, Großbritannien, Kanada, Dänemark, Deutschland, Israel, Italien und andere Länder Fälle gefunden.

Demgegenüber in den Vereinigten Staaten suchten Wissenschaftler weiter.

„Wenn wir in mehreren Ländern jener Welt eine Variante Sichtbarwerden sehen, ist meine Intuition normalerweise, dass sie schon da ist“, sagte Taj Azarian, ein Genom-Epidemiologe an jener University of Central Florida.

Am Mittwoch gaben amerikanische Beamte traut, dass Wissenschaftler es gefunden nach sich ziehen – c/o einem kalifornischen Patienten, jener kürzlich aus Südafrika zurückgekehrt war. Solange bis dorthin hatte Kanada schon sechs Fälle identifiziert; Großbritannien hatte mehr wie ein zwölf Stück gefunden.

Am vierter Tag der Woche wurden weitere Fälle in Minnesota, Colorado und New York identifiziert, welches darauf hindeutet, dass mit ziemlicher Sicherheit weitere Fälle lauern, sagten Wissenschaftler. Warum wurde die Variante nicht früher erkannt?

Es gibt verschiedene mögliche Erklärungen, darunter Reisemuster und strenge Einreisebestimmungen, die die Lehrbuch jener Variante in die Vereinigten Staaten verzögert nach sich ziehen könnten. Demgegenüber es gibt nebensächlich blinde Flecken und Verzögerungen im Genomüberwachungssystem des Landes. Da viele Labore jetzt präzise nachher jener Variante suchen, könnte die Erkennung schnell zunehmen.

Hochskalieren

Seit dieser Zeit Beginn jener Weltweite Seuche sequenzieren Wissenschaftler dasjenige genetische Werkstoff aus Proben des Virus, ein Verfahren, mit dem sie neue Mutationen wiedererkennen und bestimmte Varianten identifizieren können. Wenn sie routinemäßig und in großem Umfang durchgeführt wird, ermöglicht die Sequenzierung Forschern und Beamten nebensächlich, die Entwicklungsverlauf und Verbreitung des Virus im Ophthalmos zu behalten.

In den Vereinigten Staaten begann sie Erscheinungsform jener umfassenden Genomüberwachung nur sehr langsam. Während Großbritannien sein nationales Gesundheitswesen schnell nutzte, um ein intensives Sequenzierungsprogramm zu starten, waren die frühen Sequenzierungsbemühungen in den Vereinigten Staaten, die hauptsächlich von Universitätslabors ausgingen, begrenzter und auf Anhieb.

Sogar nachdem die CDC im Mai 2020 ein Sequenzierungskonsortium ins Leben gerufen hatte, wurden die Sequenzierungsbemühungen durch ein fragmentiertes Gesundheitswesen, fehlende Finanzierung und andere Herausforderungen gehandicapt.

Im Januar, wie die Fälle anstiegen, sequenzierten die Vereinigten Staaten laut dem Dashboard jener CDC weniger wie 3.000 Proben pro Woche, weit weniger wie 1 v. H. jener gemeldeten Fälle. (Experten empfehlen, mindestens 5 v. H. jener Fälle zu sequenzieren.)

Demgegenüber in den letzten Monaten hat sich die Situation dank einer Komposition aus neuer Bundesführung, Finanzspritzen und zunehmender Missbehagen mehr als dasjenige Aufkommen und die Verbreitung neuer Varianten tragisch verbessert, sagten Experten.

„Die genomische Überwachung hat in den USA wirklich aufgeholt und ist sehr gut“, sagte Dana Crawford, genetische Epidemiologin an jener Case Wildwestfilm Reserve University.

Dasjenige Staat sequenziert jetzt etwa 80.000 Virusproben pro Woche und 14 v. H. aller positiven PCR-Tests, die in Labors durchgeführt werden und wie Goldstandard zu Händen den Nachweis des Virus gelten, Dr. Rochelle P. Walensky, Direktorin jener Centers for Disease Control und Prävention, sagte c/o einem Briefing im Weißen Haus am zweiter Tag der Woche.

Dasjenige Problem ist, dass jener Prozess Zeit braucht, insbesondere wenn er in großen Mengen durchgeführt wird. Welcher Sequenzierungsprozess jener CDC dauert in jener Regel etwa 10 Tage, nachdem sie eine Probe erhalten hat.

“Wir nach sich ziehen eine wirklich gute Überwachung in Bezug hinaus die Quantität”, sagte Trevor Bedford, ein Könner zu Händen virale Evolution und Überwachung am Fred Hutchinson Cancer Research Center in Seattle. Er fügte hinzu: „Demgegenüber von Natur aus hinkt es im Vergleich zu Ihrer Fallberichterstattung nachher. Und so nach sich ziehen wir die Gedöns von vor zwei Wochen gut im Blick.“

Welche Erscheinungsform von Verzögerung ist in Ländern mit vielen zu sequenzierenden Proben nicht ungewöhnlich, sagte Dr. Bedford.

In einigen Staaten ist die Zeitachse sogar noch länger. Dasjenige Gesundheitsministerium von Ohio stellt steif, dass jener Prozess des „Sammelns jener Probe, des Testens, jener Sequenzierung und jener Meldung von Zustandekommen solange bis Finale mindestens 3-4 Wochen dauern kann“.

Demgegenüber jetzt, da Wissenschaftler wissen, worauf sie suchen, sollten sie in jener Stellung sein, den Prozess zu beschleunigen, während sie Proben vorziehen, c/o denen es sich am wahrscheinlichsten um Omicron handelt, sagten die Wissenschaftler.

Mit irgendetwas Hochgefühl erzeugt Omicron c/o PCR-Tests ein anderes genetisches Symbol wie die Delta-Variante, die derzeit im Wesentlichen sämtliche Coronavirus-Fälle in den USA ausmacht. (Von kurzer Dauer gesagt, Mutationen im Spike-Gen jener neuen Variante bedeuten, dass Omicron-Proben negativ hinaus dasjenige Gen getestet werden, während sie positiv hinaus ein anderes verräterisches Gen getestet werden.)

Viele Labore schicken jetzt sie Proben sowie Proben von Personen, die kürzlich aus dem Ausland zurückgekehrt sind, zur Sequenzierung.

„Jeglicher Behörden, die an jener Genomüberwachung beteiligt sind, vorziehen sie jüngsten reisebedingten Fälle“, sagte Dr. Azarian.

Vielleicht wurde jener Kernpunkt Kalifornien so schnell angezeigt. Welcher Patient kehrte am 22. November aus Südafrika zurück und begann sich am 25. November laborieren zu wahrnehmen. Die Person wurde am Montag positiv hinaus dasjenige Virus getestet und Wissenschaftler sequenzierten dann dasjenige Virus und gaben traut, dass sie zwei Tage später Omicron entdeckt hatten.

„Die schnelle Wende durch dasjenige US-Genomüberwachungssystem ist ein weiteres Denkmuster dazu, wie viel besser unser System in den letzten Monaten geworden ist“, sagte Dr. Crawford.

Tote Winkel

So sehr sich die Überwachung verbessert hat, gibt es immer noch Lücken, die die Bloßstellung weiterer Fälle in den Vereinigten Staaten verlangsamen könnten, einschließlich enormer geografischer Unterschiede.

„Manche Staaten hinken nachher“, sagte Massimo Caputi, Molekularvirologe an jener Florida Atlantic University School of Medicine.

Laut GISAID, einer internationalen elektronischer Karteikasten zu Händen virale Genome, hat z. B. Vermont in den letzten 90 Tagen etwa 30 v. H. seiner Virusfälle sequenziert und weitergegeben und Massachusetts etwa 20 v. H.. Sechs Bundesstaaten hingegen – Kentucky, Pennsylvania, Ohio, South Carolina, Alabama und Oklahoma – nach sich ziehen laut GISAID jeweils weniger wie 3 v. H. ihrer Fälle sequenziert und gemeldet.

Darüber hinaus können Wissenschaftler nur Proben aus entdeckten Fällen sequenzieren, und die Vereinigten Staaten hatten oft Sklaverei, genügend Tests durchzuführen.

“Tests sind jener schwächste Teil unserer Weltweite Seuche-Reaktion”, sagte Dr. Eric Topol, jener Gründer und Rektor des Scripps Research Translational Institute in Lanthan Jolla, Kalifornien. “Es war vom ersten Tag an.”

Obwohl sich Tests wie die Genomüberwachung seitdem den frühen Tagen jener Weltweite Seuche erheblich verbessert nach sich ziehen, sind sie immer noch sehr uneinheitlich. Und während schnelle Tests zu Hause viele Vorteile nach sich ziehen, kann die Verlagerung einiger Tests vom Laboratorium nachher Hause neue Herausforderungen zu Händen die Überwachung stellen.

“Mit zunehmenden Schnelldiagnosetests zu Hause werden sie Fälle nicht sequenziert, wenn dies nicht mit einem PCR-Test nachverfolgt wird”, sagte Joseph Fauver, ein Genom-Epidemiologe am University of Nebraska Medical Center. Dasjenige Problem sei nicht unüberwindbar, fügte er hinzu, Gewiss „vielleicht gibt es da zusammensetzen kleinen blinden Makel“.

Es gibt andere, optimistischere Gründe dazu, dass Wissenschaftler nicht mehr Fälle entdeckt nach sich ziehen, obwohl sie theoretisch bleiben.

„Vielleicht nach sich ziehen infizierte Patienten leichte Symptome und werden von dort nicht getestet und unterliegen keiner genomischen Überwachung“, sagte Janet Robishaw, Senior Associate Dean for Research am Florida Atlantic University College of Medicine.

(Es ist noch viel zu Vormittag, um zu wissen, ob Omicron eine schwerere oder weniger schwere Krankheit verursacht wie andere Varianten, herausstellen Wissenschaftler. Sogar wenn die Fälle unverhältnismäßig mild sind, welches noch nicht lichtvoll ist, könnte dasjenige daran liegen, dass die Variante meistens infiziert ist bisher junge oder geimpfte Menschen, c/o denen die Wahrscheinlichkeit einer schweren Leiden weniger bedeutend ist.)

Es ist nebensächlich möglich, dass die Variante in den Vereinigten Staaten solange bis vor kurzem nicht in jener Gemeinschaft verbreitet wurde. Wenn die Fälle meist tot sind und mit Auslandsreisen verbunden sind, können sie unter dem Überwachungsradar segeln.

„Wir suchen nachher einer Nadel im Schober, wenn wir nur einzelne Fälle suchen, die nichts miteinander zu tun nach sich ziehen“, sagte Dr. Azarian.

Obwohl noch nicht lichtvoll ist, wo Omicron entstanden ist, wurden die ersten Ausbrüche in Südafrika festgestellt, wo die Variante mittlerweile weit verbreitet ist.

Es gibt weniger Flüge zwischen dem südlichen Alte Welt und den Vereinigten Staaten wie zwischen dieser Region und Europa, wo andere frühe Omicron-Fälle entdeckt wurden, sagte Dr. Caputi.

Und solange bis Zustandekommen November hatten die USA internationale Reisende aus jener Europäischen Union und Südafrika verboten, stellte er steif. Sogar wie Beamte dasjenige Verbot aufhoben, mussten Reisende von diesen Orten weiterhin sowohl eine Impfung wie nebensächlich zusammensetzen kürzlich erfolgten negativen Covid-Test nachweisen. Welche Maßnahmen könnten die Eintreffen von Omicron verschoben nach sich ziehen.

„Es ist nicht ausgeschlossen, dass die Verbreitung von Omicron in den USA hinterherhinkt“, sagte Dr. Caputi in einer Mail.

So oder so, fügte er hinzu, erwarte er, dass Wissenschaftler bevorstehend mehr Fälle finden würden.